Điều quan trọng là canh rong biển nhưng như các loại canh khác phải được nấu chín (nước phải sôi) trước khi bảo quản và sau đó được đun nóng lại trước khi dùng. Việc nấu chín trước khi bảo quản thậm chí còn quan trọng hơn cả việc đun lại. Nơi bảo quản tốt nhất là để trong tủ lạnh. Hãy dùng một miếng màng bọc thực phẩm để bọc lại tô canh (để tránh nhiễm khuẩn chéo trong tủ lạnh), hoặc dùng một cái hộp kín khí. Nấu bảo quản đúng cách, món canh có thể để được 3 - 4 ngày trong tủ lạnh. Nếu canh chỉ có mỗi rong biển hoặc nấm thì thời gian bảo quản có thể lâu hơn, nhưng nếu canh có chứa thịt bằm, đậu hũ, thịt bò... thì chắc chẵn sẽ mau hỏng hơn bình thường.
Nếu không có tủ lạnh thì trước khi bảo quản cũng phải chắc chắn là canh được đun sôi. Sau đó, canh phải được đậy kín, tuyệt đối không được mở ra mở vào. Để canh ở nơi mát nhất có thể, và để qua đêm. Ngày hôm sau, phải đun sôi canh lại (chừng 10 phút) vì người lớn đề kháng tốt có thể không cảm nhận được những ảnh hưởng xấu nhưng trẻ em hay người bụng dạ yếu thì dễ bị đau bụng.
Trên lý thuyết, bạn cũng có thể bỏ canh vào túi và cho đông lạnh. Được bảo quản đông lạnh đúng cách (âm 18 độ C liên tục), canh sẽ duy trì chất lượng tốt nhất trong khoảng 4 đến 6 tháng, nhưng sẽ vẫn được sau thời gian đó. Dĩ nhiên, chuyện này trong thực tế chẳng mấy ai có nhu cầu đông lạnh canh cả.